安徽農業大學農學院創建于1940年，經過70多年的曲折辦學經歷，逐步發展為一個在我國東南具有較大影響力、以培養林業高層次人才和開展林業科學研究為主的高等教育機構。

農學院現有專任教師104人，其中正高級職稱25人、副高級職稱34人，博士生導師24人，碩士生導師69人，“閩江學者”和金山學者”講座、特聘教授17人,45%的專任教師具有海外留學經歷, 80%的專任教師具有博士學位，24人在國內外學術機構任理事以上職務。

農學院1940年開始招收本科生，1979年獲批全國首個經濟林碩士學位授權點，1984、1986和1994年分別獲造林學、森林經理學和森林保護學碩士學位授權點，2000年獲森林培育博士學位授權點,2005年獲林學一級學科博士學位授權點，2006年擁有林學博士后科研流動站。目前，農學院有1個博士后科研流動站，1個一級學科博士學位授權點、2個一級學科碩士學位授權點、1個專業碩士學位授權點，5個全日制本科專業，在校博士后8人，博士生42人，碩士生350人，本科生1340人。

農學院立足中國南方重點商品林產區，圍繞林業生產中的瓶頸開展科學研究，逐漸成為中國南方林業科技創新的重要單位。在杉木高效培育植物光信號傳導森林資源評估、紅壤區水土流失治理等方面形成了顯著特色。近5年，農學院主持了國家科技支撐計劃、國家重點研發計劃專項、國家自然科學基金重點項目等300多項科研項目，經費突破億元；獲福建省科技進步獎31項，其中一等獎3項、二等獎7項、三等獎21項，發表SCI和EI收錄等論文600余篇，其中植物光和激素信號傳導方面的研究成果在《Science》《Cell》《PNAS》等國際頂級學術雜志上發表，包括林學學科在內的植物學與動物學”和“農業科學”兩個學科進入ESI全球前1%行列。

農學院設有林學和地理學2個一級學科。1984年”林學學科”被評為福建省首批9個重點學科之一，1995年“經濟林產品加工”入選全國高校首批“211工程”重點學科，2000年森林培育”獲批福建省屬高校第二批211工程”重點學科，2005年森林培育”和“森林經理學”被認定為福建省重點建設學科，2006年森林培育”獲批國家林業局重點學科，2011年森林培育”學科列入福建省“國家重點學科培育建設學科,2012年”林學學科”入選福建省特色重點學科，2015年”林學學科”入選國家林業局一級重點學科，2017年“林學學科”在全國第4輪學科評估中獲評B+學科。

農學院現有省部級研發平臺15個、校級平臺19個，有4.7萬畝的2個教學林場，科研設備總值近1億元。2013年投入1.2億元，組建了基礎林學與蛋白質組學中心”，開展杉木和毛竹等樹種的分子生物學基礎研究。

農學院先后與加拿大英屬哥倫比亞大學、美國俄略岡州大學、日本東京農工大學、瑞典農業大學、英國愛丁堡大學、臺灣中興大學、嘉義大學等30多所海外(境外)高校建立了友好合作關系。近5年農學院選派了32位青年教師前往海外訪學，招收了20多名來自越南、巴基斯坦、泰國、蘇丹、喀麥隆、尼泊爾、加蓬、埃塞俄比亞等國家的留學生。農學院“中美加林業創新型人才培養”獲國家留學基金委立項資助，與加拿大不列顛哥倫比亞大學合作實施了“生態學3+2本科生培養項目，一大批本科生和研究生到海外交流學習。